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单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,转录,(transcription):以DNA单链为,模板,,核苷三磷酸,NTP,(,ATP,GTP,CTP,UTP四种核糖核苷三磷酸)为,原料,,在,RNA聚合酶催,化下,合成,RNA链,的过程。,转录的条件,:,模板,DNA(不对称转录),原料,NTP,酶,RNA聚合酶,产物,mRNA,tRNA,rRNA,配对,A-U,T-A,G-C,方向,5 3,引物,不需要,转录,转录(transcription):以DNA单,转录通用公式:,模板,N,n,+,NTP,模板,N,n+1,+,PPi,M,g,2+,RNA聚合酶,1.原料是NTP(ATP,GTP,CTP,UTP四种,核糖核苷三磷酸,)。,2.RNA聚合酶+,镁,。,3.起始链核苷酸为嘌呤核苷三磷酸,5端保持三磷酸集团。,4.DNA双链上,一股链可转录,另一股不转录。,5.有意义链与反意义链并非固定不变。,6.转录方向都是5 3,转录通用公式:模板Nn+NTP模板Nn+1+PPiMg2+R,模板链:,反意义链,antisense strand,:以该链中的,DNA碱基顺序指导RNA的合成-,被转录的那条,DNA 链,。,编码链,:,有意义链,sense strand/template strand:不被转录的那条DNA链。,几个基本概念,模板链:几个基本概念,5-GCAGTACATGTC-3编码链,DNA,3-CGTCATGTACAG-5模板链,5-GCAGUACAUGUC-3 mRNA,N-Ala-Val-His-Val-C,蛋白质,脱氧核糖核酸转录课件,有两方面含义:,1)DNA分子双链上的某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;,2)模版链并非永远在同一单链上。,双链,DNA分子上分布着,很多基因,,并不是所有基因的转录均在同一条,DNA单链上,而是一些基因在这条单链转录,另一些基因的转录在另一条单链上,,DNA双链一次只有一条链可作为模板转录,,称之为,不对称转录,。,有两方面含义:双链DNA分子上分布着很多基因,并不是所有基因,RNA 聚合酶 以DNA 为模板,催化 2个游离的 NTP形成 3,5-磷酸二酯键。,RNA 聚合酶 以DNA 为模板,催化 2个游离的 NT,1、大肠杆菌RNA聚合酶的组成,西格玛,1、大肠杆菌RNA聚合酶的组成西格玛,全酶(Holo Enzyme)和核心酶(Core Enzyme),Core Enzyme,Holo Enzyme,全酶(Holo Enzyme)和核心酶(Core,(1)全酶(Holo Enzyme),用于转录的,起始,依靠,空间结构,与DNA模板结合,专一性,地与DNA序列(启动子)结合,(2)核心酶 (Core Enzyme),作用于转录的,延伸过程,依靠,静电引力,与DNA模板结合,非专一性,的结合(与DNA的序列无关),(1)全酶(Holo Enzyme)(2)核,2、各亚基的特点和功能,(1),因子,因子可,重复使用,修饰,RNA聚合酶的构型,使Holo Enzyme,识别启动子,的特定区域,2、各亚基的特点和功能,不同的,因子识别不同的启动子,E.coli 中有,五,种,因子(,70,、,32,、,54,、,28,、,24,),枯草杆菌中有11种,因子,(2),因子,核心酶的组建因子,促使RNApol 与DNA模板链结合,2,2,前端,因子使模板DNA双链变单链,尾端,因子使单链DNA重新聚合为双链,不同的因子识别不同的启动子核心酶的,(3),因子,促进RNA elongation,完成磷酸酯键的连接,Editing 功能(排斥与模板链不互补的碱基),(3)因子 促进RNA elongati,E site,:对NTP非专一性地结合,(4),因子,参与RNA非模板链的结合,(充当SSB),构成Holoenzyme 后,,因子含有两个位点,I site,:该位点专一性地结合ATP或GTP,(利福霉素,rifamycin、利福平 rifampin)抑制,I位点,(利迪链菌素 streptollydigin)抑制,E位点,E site:对NTP非专一性地结合(4)因子,敏感度是指浓度抑制力:,高(,10,-9,10,-8,mol/L),,中(10,-5,10,-4,mol/L),,低(大于10,-3,mol/L)。,敏感度是指浓度抑制力:,一、真核生物的RNApol,1、,三种RNApol:,根据对,-鹅膏蕈碱的敏感性不同而分类,RNApol 最不敏感 (动、植、昆),RNApol,最敏感,RNApol 不同种类(物种)的敏感性不同,2、位置和转录产物,RNApol,核仁 活性所占比例最大,转录rRNA(5.8S、18S、28S),一、真核生物的RNApol,RNApol,核质 主要负责,hnRNA、snRNA,的转录,hnRNA(mRNA 前体,核不均一RNA,heterogeneous nuclear RNA),snRNA(核内小分子 RNA small nulear,RNA),RNApol,核质 负责,tRNA,RNApol 核质 主要负责,二、真核生物的启动子,三,种,RNApol 识别,三,种启动子,三,种聚合酶,需要不同的转录因,子,-TF、TF,、TF 等,三,种转录方式,三,种产物:,RNA聚合酶mRNA前体;,RNA聚合酶rRNA;,RNA聚合酶tRNA,二、真核生物的启动子,脱氧核糖核酸转录课件,RNA 的转录包括 promotion.elongation.termination,三过程,从启动子(promoter)到终止子(terminator)称为转录单,位(transcription unit),原核生物的转录单位,有操纵子,operon,真核生物中的转录单位,无,operon,转录起点,即转录原点记为1,其上游记为负值,下游,记为正值,upstream start point downstream,10,1,10,RNA 的转录包括 promotion.elonga,一、原核生物启动子和终止子,启动子(,promoter,):,RNA聚合酶的结合区域,。,启动子的特点,:,(1)在转录起始点的5端,(2)TTGACA:Sextama框,RNA聚合的识别部位(酶靠,亚基与之结合),在-35区。,(3)TATAAT:Pribnow 框,RNA聚合酶的结合区,在-10区。,一、原核生物启动子和终止子,Pribnow 框,结合位点,Sextama框,识别位点,Pribnow 框Sextama框,(1),Sextama 框(Sextama Box),RNA聚合酶的,松弛结合,(只为识别),,RNA聚合酶依靠其,亚基,识别该位点,决定了启动子的强度,不同启动子中位置略有变动,(,2)Pribonow 框(Pribonow Box),RNA聚合酶的牢固结合位点,一致序列:TATAAT,(1)Sextama 框(Sextama Box)(2),原核生物的终止子,终止子:,提供转录终止信号的一段,DNA 序列,。,两个主要特征:,1.反向重复序列:,5,-CGGATG,|CATCCG-3,3,-GCCTAC|,GTAGGC-5,反向序列的,长度,和,GC含量,直接,影响,RNA二级结构的稳定性,!,2.反向重复序列后接寡聚U,原核生物的终止子终止子:提供转录终止信号的一段 DNA 序列,脱氧核糖核酸转录课件,二、,真核生物启动子,真核生物中有三种不同的,RNA聚合酶,,因此也有三种不同的启动子,,其中以,启动子,最为复杂,。,(,1)有多种元件:TATA框,GC框,CAAT框,OCT等;,(2)结构不恒定;,(3)它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同;,(4)有的有远距离的,调控元件,,元件起到控制,转录效率,和,选择起始位点,的作用;,(,5)转录时先和其它,转录激活因子,结合,再和聚合酶结合。,增强子,-200,二、真核生物启动子增强子-200,(,1)TATA框:顺序TATAATAAT,在转录起始点上游约-25-30bp处,基本上由A-T碱基对组成,,RNA聚合酶与TATA框牢固结合之后才能,开始,转录,。,(,2)CAAT框:顺序GGGTCAATCT,位于转录起始点上游约-80-100bp处,也是RNA聚合酶的一个结合处,,控制着转录起始的,频率,。,(,3)GC框:有两个拷贝,位于CAAT框的两侧,由GGCGGG组成,是一个,转录调节区,。,(1)TATA框:顺序TATAATAAT,在转录起始点上游约,二、延伸,以原核生物的RNA连延伸过程为代表,亚基脱离酶分子:,核心酶与,DNA的结合变松,较容易继续前移。,核心酶无专一性,能,转录模板上的任何序列,,包括在转录后加工时待切除的,居间序列,。,脱离核心酶的,亚基,可与另外的核心酶结合,,参与另一转录过程。,随着转录不断延伸,,DNA双链顺次地被打开,,并接受新来的碱基配对,合成,新的磷酸二酯键,后,,核心酶向前移去,,使用过的,模板重新关闭,,恢复原来的双链结构。,一般合成的,RNA链对DNA模板具有,高度的忠实性,。,RNA合成的速度,,原核,为,2550个核苷酸/秒,,真核,为,45100个核苷酸/秒。,二、延伸,脱氧核糖核酸转录课件,三、终止,终止:包括,停止延伸,+,释放,RNA聚合酶,及,合成的,RNA,。,原核生物:,基因或操纵子的末端通常有一段终止序列即终止子。,真核生物:,DNA上也有转录终止的信号区。转录单元的,3端均富有AT序列,,在,相隔,030bp之后又出现TTTT序列,(通常是,35个T)。,三、终止终止:包括停止延伸+释放RNA聚合酶及合成的RNA。,脱氧核糖核酸转录课件,脱氧核糖核酸转录课件,转录产物的后加工,1.mRNA前体的后加工,原核,mRNA的原始转录产物都可直接用于翻译;,真核,mRNA一般都有相应的前体,,前体必须经过后加工才能用于转译蛋白质,。,真核,mRNA的原始转录产物-hn RNA-最终被加工成成熟的mRNA。,转录产物的后加工1.mRNA前体的后加工,后加工:,戴帽:装上,5端帽子,,转录产物的,5端核苷酸的2,位羟基被甲基化,装上,甲基化的帽子,。,Cap的重要性:,为,核糖体识别,mRNA,提供信号,;可增加,mRNA稳定性,保护其在转运时,免遭核酸酶水解,。,后加工:,脱氧核糖核酸转录课件,剪接:,将hnRNA中的,内含子,切除,,将,外显子,拼接,。,内含子参与转录但不表达,,,转录后,RNA的分子量比成熟mRNA大几倍或几十倍,,因此需要,切除内含子,,,连接外显子,。,剪接:,脱氧核糖核酸转录课件,脱氧核糖核酸转录课件,加帽,5端:m,7,GpppGpN,作用:稳定mRNA 5端和翻译的起始有关,加尾,3端:polyA尾巴,作用:稳定mRNA和翻译模板活性有关,mRNA前体的剪接,剪除内含子,连接外显子,脱氧核糖核酸转录课件,2.tRNA前体的后加工,tRNA,前体,有两类:,单个,tRNA前体,在5和3端各有一段多余顺序;,含二个tRNA的前体,除5和3端有长短不一的多余顺序外,在,两个,tRNA之间还有数目不等的核苷酸隔开,。,真核生物,tRNA前体后加工的相似步骤:,修饰:对tRNA分子上的部分核苷酸进行修饰(,包括甲基化、酰化、硫代和重排,等);,tRNA前体的,剪接,,切除,5端的先导序列;,添加或修复,3端CCA序列,。,2.tRNA前体的后加工,真核生物的,18s rRNA、5.8s rRNA、28s rRNA,基因串联构成转录,单位,-rDNA,。,每个,rDNA单位转录出45S的rRNA前体,前体经剪切后产生,18s rRNA、5.8s rRNA、28s rRNA,rRNA 转录后的加工,真核生物的18s rRNA、5.8s rRNA、28s,脱氧核糖核酸转录课件,逆转录:,RNA 为模板,有逆转录酶的参与,在 4种,dNTP存在及适合的条件下,按碱
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