Click to edit Master title style,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,细菌(xjn)的分类和命名,第一页，共39页。,微生物的分类,分类是认识客观事物的一种基本方法。,因此(ync)，我们要认识、研究和利用各种微生物资源也必须对它们进行分类。,分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分：分类、鉴定、命名,第二页，共39页。,属 具有共性的若干种的组合，应与其它(qt)属有明显的差异。,用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若干检测(jin c)项目。,第二节 细菌(xjn)的命名,Escherichia coli 大肠埃希氏菌,第三十二页，共39页。,直接(zhji)涂片镜检,二、鉴定(jindng)方法,在兽医(shuy)微生物学中，不占重要地位。,Staphylococcus aureus,属名 种名,细菌感染的检查方法与防治(fngzh)原则,细胞(xbo)的群体形态,手册(shuc)第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、支原体和立克次氏体等归于原核生物界。,凡是16S rRNA序列同源性大于97的两株细菌，即可确定为同一种。,凡是16S rRNA序列同源性大于97的两株细菌，即可确定为同一种。,第一节 细菌(xjn)的分类地位,分类:根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述(mio sh)，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。,(根据现有数据建立系统的过程),鉴定：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。,(根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程),命名：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称。,(分类系统建立过程中的步骤之一),第三页，共39页。,第一节 细菌(xjn)的分类地位,细菌(xjn)过去归属植物界，自1974年以来，划为原核生物。,细菌(xjn)属于原核生物界，为种系分类的真细菌(xjn)；,广义的细菌(xjn)包括各类原核细胞型微生物，如细菌(xjn)、放线菌、衣原体、支原体、立克次体和螺旋体；,狭义的细菌(xjn)专指其中的细菌(xjn)，它的种类最多、数量最大、最具代表性。,细菌(xjn)的分类层次 与其他生物相同，也是界、门、纲、目、科、属、种。在细菌(xjn)中常用属和种。,第四页，共39页。,细菌在原核生物界的位置,手册(shuc)第八版把细菌、放线菌、粘细菌、螺旋体、支原体和立克次氏体等归于原核生物界。原核生物界共设2门、6纲、19部分。,原核生物界（Kingdom:Procaryolae）,1.光合营养(yngyng)原核生物门（Photobacteria）,纲.蓝绿色光合细菌纲(Bluc-green Photobacteria),纲.红色光合细菌纲（Red Photobacteria）,纲.绿色光合细菌纲（Green Photobacteria）第1部分,2.化能营养(yngyng)原核生物门（Scolobacteria）,纲.细菌纲(Bacteria)第2至第17部分,纲.立克次体纲（Rickettsia）第18部分,纲.柔膜体纲（Molliculcs）第19部分,第五页，共39页。,第六页，共39页。,第七页，共39页。,古细菌,是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极端耐盐、高度嗜热，其细胞壁组成与细菌不同。,这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期产物，因此称之为古细菌。,在兽医(shuy)微生物学中，不占重要地位。,第八页，共39页。,第九页，共39页。,第一节 细菌(xjn)的分类地位,第六节 细菌(xjn)的鉴定,属 具有共性的若干种的组合，应与其它(qt)属有明显的差异。,种名 属名,凡是16S rRNA序列同源性大于97的两株细菌，即可确定为同一种。,后一字为种名，用形容词，小写。,模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。,生化性质(xngzh)和生态特征,一、分类(fn li)培养,每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词，第一个字母大写；,属 具有共性的若干种的组合，应与其它(qt)属有明显的差异。,属名 通常是一个描述(mio sh)生物形态的名词或发现该生物的人名，词首必须大写。,属名 种名,第三十四页，共39页。,第三十五页，共39页。,亚属和属指定(zhdng)模式种（type species）；,第十页，共39页。,细菌(xjn)的分类等级,第十一页，共39页。,属 具有共性的若干种的组合，应与其它(qt)属有明显的差异。不同的属之间的16S rRNA序列有较大差异，差异应大于57。,种 是微生物学分类的最基本单元，可以认为是一群(y qn)性质相似的菌株，与其它菌株群体有明显差异。,凡是16S rRNA序列同源性大于97的两株细菌，即可确定为同一种。,第十二页，共39页。,亚种 是指同一菌种的各个细菌，虽然基本性状基本相同，但是在某些方面仍有一定(ydng)差异，差异较明显的称为亚种，差异不明显的称为型。,新种 是指权威性的分类、鉴定手册种从未记载过的一种(y zhn)新分离并鉴定过的微生物。,第十三页，共39页。,菌株 是不同来源的某一种细菌的纯培养物。,同一种细菌可有许多菌株，其主要(zhyo)性状应完全相同，次要性状可稍有差异。,标准菌株 又叫模式菌株，具有(jyu)某种细菌典型特征的菌株。,第十四页，共39页。,种和亚种指定(zhdng)模式菌株（type strain）；,亚属和属指定(zhdng)模式种（type species）；,属以上至目级分类单元指定(zhdng)模式属（type genus）；,模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。,第十五页，共39页。,第二节 细菌(xjn)的命名,依据“国际细菌命名法规”的规定，采用(ciyng)拉丁双名法，,每个菌名由两个部分组成，前一字为属名，用名词，第一个字母大写；后一字为种名，用形容词，小写。均为斜体。,中文的命名次序 与拉丁相反，种名在前，属名在后。,属名 种名,种名 属名,金黄色葡萄球菌(p to qi jn),Staphylococcus aureus,第十六页，共39页。,亚种 在学名(xumng)后加上ssp.或subsp.（正体）。,新种 在学名(xumng)后加上sp.nov.（正体）。,第十七页，共39页。,属名 通常是一个描述(mio sh)生物形态的名词或发现该生物的人名，词首必须大写。,种名 表示该生物的某种特征、寄居部位或所致疾病等，字母须小写。,Staphylococcus aureus 金黄色葡萄球菌(p to qi jn),Escherichia coli 大肠埃希氏菌,第十八页，共39页。,拉丁文学名应该(ynggi)按拉丁文字母的发音规则读念，用英语读念是错误的。,第十九页，共39页。,第三节 细菌(xjn)分类鉴定的标准,形态特征,培养特征,生理特征,生态特征,化学(huxu)组成,血清学反应,遗传学特性,细菌(xjn)分类依据,第二十页，共39页。,1.经典(jngdin)鉴定方法的指标,A.基本形态:,球状球菌；杆状杆菌；螺旋状螺旋菌,第二十一页，共39页。,B.细胞(xbo)的形状、大小、结构和染色反应,第二十二页，共39页。,第二十三页，共39页。,C.细胞(xbo)的群体形态,第二十四页，共39页。,第二十五页，共39页。,第二十六页，共39页。,D.生化性质(xngzh)和生态特征,第二十七页，共39页。,2.分子生物学方法,分类的依据：遗传(ychun)特征,第二十八页，共39页。,第二十九页，共39页。,第三十页，共39页。,第四节 细菌分类(fn li)的方法,一、双歧检索(jin su)条目分类法,细菌分类采用传统的双歧检索(jin su)条目分类法。,此法首选要在细菌的各种性状中，选择一项或数项被认为是最主要的基本性质，作为分类指征，在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别；然后在这些类别中选择数项次要性状为指征，将细菌作次一等阶分类，依此类推，一直划分到种。,人为影响因素多，但实际临床检验很实用。,第三十一页，共39页。,二、数值(shz)分类法,原理 根据数值分析，借助(jizh)电子计算机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。,各种性状(xngzhung)同等重要，应用多菌株比较。,所选性状(xngzhung)越多，正确性越高，至少要达到100个，否则易误判。,优点：科学、规范,缺点：需要电子计算机,第三十二页，共39页。,1、伯吉氏细菌鉴定(jindng)手册（Bergeys Manual of Determinative Bacteriology)，D.Bergey（美国细菌学家），1923年第1版，1994年第9版。,2、伯吉氏系统(xtng)细菌学手册（Bergeys Manual of Systematic Bacteriology)，Holt（美国细菌学家），1984-1989年编写完第1版共4卷，2001年开始发行第2版共5卷。,第五节 细菌的分类(fn li)体系,第三十三页，共39页。,3、Balows等编著(binzh)的“原核生物”(The Prokaryyotes):第二版，1992，可弥补伯吉氏手册的不足。,4、国际系统与进化微生物学杂志（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology,IJSEM）：是细菌分类命名的世界公认的权威期刊，由国际微生物学会联合会（International Union of Microbiological Societies）于1901年创刊出版。,第三十四页，共39页。,第六节 细菌(xjn)的鉴定,一、分类(fn li)培养,一般只有纯培养(piyng)的细菌才能进行鉴定。,第三十五页，共39页。,二、鉴定(jindng)方法,除按表型特征、DNA同源性或rRNA序列比较等方法鉴定细菌外.,其他(qt)方法，如测定细菌的脂肪酸组成，用气相液相质谱分析细菌的脂肪酸谱，每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的，可重复性好，因此此法可用于细菌的鉴定或分类，往往结合常规方法参照应用。,在有条件的单位可用PCR技术检测鉴定细菌。,用商品化的细菌鉴定试剂盒，取代自行选择若干检测(jin c)项目。,第三十六页，共39页。,细菌学诊断(zhndun),细菌感染的检查方法与防治(fngzh)原则,标本的采集(cij)和运送,避免杂菌污染,运送注意保存,不同期不同标本,用抗菌素以前,采集病变明显部位,标本必须新鲜,第三十七页，共39页。,革兰阳性细菌,球菌,杆菌,丝状及树枝状,产生芽孢革兰,阳性大杆菌,无芽孢,抗酸染色阳性,抗酸染色阴性,革兰阴性细菌,球菌,/,球杆菌,杆菌,MZN,染色阳性,MZN,染色阴性,弧状杆菌,丝状菌,中等大小杆菌,螺旋状菌,细菌(xjn)的革兰染色,第三十八页，共39页。,病原菌的检查程序,药物敏感(mngn)试验,标本(biobn),直接(zhji)涂片镜检,分离培养,生化试验,血清学试验,动物试验,明确诊断,初步诊断,分子生物学技术,其他检测技术,第三十九页，共39页。,