,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,#,细菌的分类与命名,第一节 细菌的分类,第1页/共20页,一、细菌的分类地位,细菌归属于,原核生物界,(,Procaryotae,),原核生物分两大类：,细菌,古细菌,第2页/共20页,细菌（,Bacteria,）,又称真细菌（,Eubacteria,），包括细菌、放线菌、螺旋体、霉形体、立克次氏体、衣原体等，此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。,第3页/共20页,古细菌（,Archaea,）,是,16SrRNA,寡核苷酸序列以及其他一些细胞组分在分子水平上与真核细胞和原核细胞的组分都有所不同的一类细菌，包括产甲烷菌、极端嗜盐菌、高度嗜热菌等。在兽医微生物学中，古细菌不占重要位置。,第4页/共20页,二、细菌分类的等级单元,与其他生物相同，按,界、门、纲、目、科、属、种、型,排列。,如两个等级之间中间类型过多，则加相应的亚类，如,亚门、亚科、亚种,等。,第5页/共20页,最重要和最基本的分类单元,在微生物分类中,种,是最重要和最基本的分类单元，相似的种划归到一起构成属，相似属构成科，依此类推，最高的分类单元为界。,目前科和科以上的划分在细菌学中还不太完善，而且随着研究的深入，科、属的划分还会发生变动。,第6页/共20页,三、种和种以下分类单位及含义,1,、种（,species,）,种是细菌分类的基本单位。凡是生物学性状高度相似，在遗传性上属于同源（同源性大于,97%,）的一类细菌，可划归入一个种。同种细菌主要性状应该相同，但某些性状仍可有一定的差异，根据这些差异进一步划分，则形成亚种及型等。,第7页/共20页,2,、亚种,(Subspecies),同种细菌内，根据某一性状的不同可划分成亚种。这一性状通常是变异的且是稳定的。,如：,马链球菌马亚种,金黄色葡萄球菌厌氧亚种,第8页/共20页,3,、型（,type,）与亚型（,subtype,）,同种细菌某一性状有差异，但这种差异不象亚种那样显著时，则划分为型。型常被用于亚种以下的细分，划分型仅从某一性状上来分。,如：根据,抗原性 抗原型（血清型）,噬菌体裂解 噬菌体型,生化反应 生化型,生物学特性 生物型,同型细菌按其微细差异进一步划分，则划分为不同的亚型，亚型不属于细菌正式的分类单元。,第9页/共20页,4,、菌株（,strain,）,又称品系，为同种细菌不同来源的纯培养物。同种细菌可有多个菌株，菌株的主要性状应相同，次要性状可稍有差异。,具有该种细菌典型特征的菌株，为该菌的标准菌株（典型菌株或代表菌株），可供细菌鉴定及科研中作参考菌株。,菌株的命名没有一定的规定，通常用地名或动物名的缩写加编号作菌株名。,第10页/共20页,5,、群或组,(group),不是正式的分类单元，在任何一级都可借用。在自然界常可发现某些细菌的特征是介于两种细菌之间，彼此不易严格区分，我们就把这两种细菌和介于他们之间的种类，划归为一个群。如大肠菌群。,第11页/共20页,四、细菌分类鉴定的标准,长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征，即形态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用，尤其在临床微生物学实践中，至今仍有应用价值。,第12页/共20页,目前分类主要的依据,主要是根据种系发生关系，即分析其基因的同源性，从而确定分类地位。,方法主要采用三种：,测定,DNA,分子中碱基,(G+C)mol%,核酸分子杂交,16SrRNA,寡核苷酸编目,第13页/共20页,五、细菌的分类体系,伯吉氏系统细菌学手册,（,Bergey,s Manual of Systematic Bacterology,），由美国细菌学家,Holt,主编，共四卷：,第,1,卷 一般医学和工业方面重要的,G,-,细菌（,1984,年）,第,2,卷 放线菌以外的,G,细菌（,1986,年）,第,3,卷 古细菌、蓝细菌及其他,G,细菌（,1989,年）,第,4,卷 放线菌（,1989,年）,从,2001,年开始发行第,2,版，共分,5,卷，计划在数年内出齐，内容将反映分子水平的细菌分类。,第14页/共20页,该书的姐妹篇是,“,伯吉氏细菌鉴定手册,”,（,Bergey,s Manual of Determinative Bacterology,），简要的描述了各个属的性状及属内各种的简明比较。自,1923,年出版第一版以来，经多次修订，于,1984,年出到了第九版。并改名为,“,伯吉氏系统细菌学手册,”,。,第15页/共20页,有关分类位置发生变化和分离鉴定新细菌的论文，都应在,“,国际系统与进行微生物学杂志,”,（,IJSEM,）原名,“,国际系统细菌学杂志,”,（,IJSB,）发表，如在其他杂志发表，必须提交论文副本给该杂志公布，两年后无异议，所提出的新细菌名称才能生效。,第16页/共20页,第二节 细菌的命名,第17页/共20页,细菌的命名依据国际细菌命名法规采用,“,双名法,”,命名。即用,“,属名,”,加,“,种名,”,来表示一个生物的学名。,书写时,“,属名,”,在前，用拉丁文或拉丁化的名词表示，且第一个字母大写；,“,种名,”,在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词所有格，小写。译成中文时，种名在前，属名在后。,如：,Staphylococcus aureus,金黄色葡萄球菌,第18页/共20页,科以上的名称：,用不同的拉丁词尾来表示,:,科,aceae,目,ales,纲,tes,门,phyta,。,第19页/共20页,