,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,Noncodi,n,g RNA,的 研究进展报告,生科院 彭瀚辉,2013.11.29,Noncoding RNA 的 研,Noncoding RNA,1.,2.,5.,4.,3.,Introduction,Classification,Research progress of ncRNA,The relationship with major disease,Future,Noncoding RNA1.2.5.4.3.I,Introduction,Introduction,Noncoding RNA,非编码 RNA(ncRNA)存在于绝大多数生物体中，是一类不编码蛋白质的 RNA 分子，随着基因组测序等相关技术的进步与发展，越来越多的 ncRNA 及其生物学功能被揭示出来，ncRNA 在发育、代谢和疾病等生命活动中都起着重要 的作用。,Noncoding RNA非编码 RNA(ncRNA),在哺乳动物基因组中,mRNA,只占全部转录本的,2,其余,98,为非编码,RNA,在哺乳动物基因组中mRNA只占全部转录本的2,其余98为,Classification,Classification,以长度划分,小于,50nt,:mi,cro,RNA，siRNA，piRNA等。,50500nt:rRNA,，,tRNAsnRNA,，,snoRNA,，,SLRNA,，,SRPRNA,等。,大于,500nt:mRNA-like noncoding RNA,等。,非编码,RNA,短链非编码,RNA,长链非编码,RNA,以长度划分小于50nt:microRNA，siRNA，pi,mi,cro,RNA：微,RNA,，长度约,22nt,，与基因表达、细胞周期以及个体发育过程调控领域起着超乎预料的重要的作用。,siRNA：内源性,siRNA,，最早被发现于果蝇，其长度为,21bp,，是一种与微,RNA,大小相似的双链,RNA,分子，它在,RNA,干扰,(RNAi),途径中介导序列专一,mRNA,的降解。,piRNA：piRNA的名称来自其与,Piwi,蛋白密切相关，长度 是,3,个小,RNA,分子中最长的，约为,24-31n t,，具有抑制可移 动的基因扩增 和移位，及维持基因组稳定性方面等功能,.,短链非编码,RNA,microRNA：微RNA，长度约22nt，与基因表达、细胞,长链非编码,RNA,（,50,5,00nt）,rRNA和tRNA,snRNA：,小核,RNA(smallnuclearRNA),，它是真核生物转录后加工过程中,RNA,剪接体（,spliceosome,）的主要成分，参与,mRNA,前体的加工过程。,snoRNA：核仁小分子,RNA,，参与,rRNA,的加工，并指导,rRNA,上特异位点的甲基化或假尿嘧啶化。,SLRNA：反式剪切引导,RNA,（,trans-splicing leader RNA,），反式剪切是真核生物,mRNA,成熟的过程之一。反式剪切过程包括剪切引导,SLRNA,以及,mRNA,的转录和连接过程。,SRPRNA：信号识别颗粒,(signalrecognition particle,SRP)RNA,，是,SRP,的组成部分，与细胞内蛋白质的运转有关。,长链非编码RNA（50500nt）rRNA和tRNA,长链非编码,RNA,（大于,5,00nt）,mRNA-like noncoding RNA：,类,mRNA RNA,，是一类,3,端有,PolyA,，无典型,ORF,，不编码蛋白质的,RNA,分子，与细胞的生长和分化、胚胎的发育、肿瘤的形成和抑制密切相关的调节子。,长链非编码RNA（大于500nt）mRNA-like non,非编码RNA的研究进展课件,Research progress of NcRNA,Research progress of NcRNA,ncRNA,的研究技术进展,ncRNA,研究工作,大规模的鉴定新的非编码,RNA,通过各种新方法研,究非编码,RNA,的功能,理论预测,实验发现,借助计算机，从已有的非编码,RNA,中提取特征信息，然后以特征信息做全基因组搜索,简便快捷,以理论预测为目标进行大量的相关实验以发现全新的,ncRNA,相辅相成,准确可靠,构建非编码,RNA,的,cDNA,文库,构建高密度的覆盖全基因组的芯片,RNomics,基因芯片,简单快捷，工作量小，可以检测到大量低丰度的非编码,RNA,对仪器要求较高，成本也很高,操作简单，成本很低,不能准确的确定转录起始终止位点，也很难区分剪切加工产物,ncRNA的研究技术进展ncRNA研究工作大规模的鉴定新的非,Rnomics,罗氏,454,基因组测序仪,Solexa,高通量测序仪,RNomics,的核心在于构建非编码,RNA,的,cDNA,文库，可以直接测序，这种方法简单快捷，工作量小，可以检测到大量低丰度的非编码,RNA,，但是对仪器要求较高，成本也很高，目前使用的测序仪主要有,454,和,solexa,两种。,而传统的克隆测序，工作量很大，且对低丰度的非编码,RNA,检测效率较差，但是这种方法操作流程比较简单，且对仪器设备要求不高，成本相对较低，因此现在仍被广泛使用。,目前,Ambion,公司、,Invitrogen,公司以及,Qiagen,公司都推出了可以用来构建非编码,RNA,cDNA,文库的试剂盒。随着技术的改进和成本的降低，这种直接测序的方法将成为主流。,Rnomics罗氏454基因组测,全基因组,tiling,芯片技术,2000,年以后发展起来的广泛使用的非编码,RNA,检测技术，这种技术的核心在于构建高密度的覆盖全基因组的芯片，这种技术的优点在于不用构建,cDNA,文库，更不用做克隆，只要有分离纯化的非编码,RNA,就可以检测，操作简单，成本很低，可以检测到大量低丰度的非编码,RNA,。缺点在于不能准确的确定非编码,RNA,的转录起始终止位点，也很难区分剪切加工产物。,目前生产这种芯片的主要有,affymetrix,公司和,agilent,公司,烟草全基因组芯片,全基因组tiling芯片技术2000年以后发展起来的广泛使用,非编码,RNA,的功能研究现状,非编码,RNA,的功能研究目前主要集中在,microRNA,和,siRNA,，主要原因在于这两种小,RNA,的功能作用方式，都是通过同目标基因进行碱基配对，寻找这些小,RNA,的靶点相对来讲比较容易。,而对于长的非编码,RNA,来讲，它们往往要形成复杂的二级甚至是三级结构，预测其靶点比较困难。,随着研究的深入，也有为数众多的长的非编码,RNA,的功能被鉴定出来，例如,Xist,和,Khps1,就属于长的带,polyA,尾巴的非编码,RNA,。,非编码RNA的功能研究现状非编码RNA的功能研究目前主要集中,The rel