单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,精选ppt,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,二级,三级,四级,五级,精选ppt,*,第五讲:BLAST 序列比对,1,精选ppt,第五讲:BLAST 序列比对1精选ppt,1.B,asic,L,ocal,A,lignment,S,earch,T,ool,2.Compare a query sequence to all the sequences,in a specified database,2,精选ppt,2精选ppt,BLAST的常用种类(详细见教材):,1、blastn,2、blastp,3、tblastn,4、blastx,5、tblastx,3,精选ppt,3精选ppt,例1:对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为nt,物种为Eukaryota,4,精选ppt,例1:对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为n,5,精选ppt,5精选ppt,6,精选ppt,6精选ppt,7,精选ppt,7精选ppt,8,精选ppt,8精选ppt,9,精选ppt,9精选ppt,10,精选ppt,10精选ppt,11,精选ppt,11精选ppt,12,精选ppt,12精选ppt,13,精选ppt,13精选ppt,14,精选ppt,14精选ppt,例2:对给定的olfactory receptor基因进行blastn,目标数据库为nt,物种为Eukaryota,15,精选ppt,例2:对给定的olfactory receptor基因进行b,16,精选ppt,16精选ppt,17,精选ppt,17精选ppt,18,精选ppt,18精选ppt,19,精选ppt,19精选ppt,20,精选ppt,20精选ppt,21,精选ppt,21精选ppt,22,精选ppt,22精选ppt,作业:对给定的2个基因(test1,test2)分别进行 blastn,blastp,tblastn,tblastx,blastx,23,精选ppt,作业:对给定的2个基因(test1,test2)分别进行 b,感谢亲观看此幻灯片,此课件部分内容来源于网络,,如有侵权请及时联系我们删除,谢谢配合!,24,感谢亲观看此幻灯片,此课件部分内容来源于网络,24,